Бердянський прикордонний загін виконує завдання з охорони державних рубежів в межах Запорізької області.

Основними завданнями прикордонного загону є контроль за дотриманням прикордонного режиму та плаванням і перебуванням українських та іноземних невійськових суден і військових кораблів в акваторії Азовського моря.

Патрулювання моря здійснюється штатними прикордонним катерами у взаємодії з тактичними групами загону Морської охорони та бойовими катерами Військово-морських сил.

Збільшення щільності прикриття дозволило значно покращити стан забезпечення безпеки в акваторії Азовського моря. Надводна обстановка відстежується цілодобово. На будь-які її зміни вживаються відповідні заходи реагування.